Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms