Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BbxQ8VBW5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms