Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2C8

Vmn1r18, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r18Q8R2C8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms