Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CipcQ8R0W1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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