Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CcsapQ8QZT2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CcsapQ8QZT2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms