Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hecw1Q8K4P8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hecw1Q8K4P8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms