Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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