Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Polr1eQ8K202 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Polr1eQ8K202 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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