Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Znf628Q8CJ78 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Znf628Q8CJ78 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Znf628Q8CJ78 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Znf628Q8CJ78 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Znf628Q8CJ78 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Znf628Q8CJ78 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Znf628Q8CJ78 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Znf628Q8CJ78 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Znf628Q8CJ78 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Znf628Q8CJ78 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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