Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Trip10Q8CJ53 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip10Q8CJ53 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms