Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TwnkQ8CIW5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms