Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Upp2Q8CGR7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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