Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nrip1Q8CBD1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms