Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fbxo48Q8CAT8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms