Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccser1Q8C0C4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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