Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK6

Ythdf3, YTH domain-containing family protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf3Q8BYK6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ythdf3Q8BYK6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms