Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
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Usp38Q8BW70 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Usp38Q8BW70 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Usp38Q8BW70 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Usp38Q8BW70 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Usp38Q8BW70 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Usp38Q8BW70 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Usp38Q8BW70 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Usp38Q8BW70 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Usp38Q8BW70 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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Usp38Q8BW70 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Usp38Q8BW70 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Usp38Q8BW70 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp38Q8BW70 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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