Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdcl3Q8BVF2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcl3Q8BVF2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms