Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Usp43Q8BUM9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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