Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ47

Cnpy4, Protein canopy homolog 4, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy4Q8BQ47 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnpy4Q8BQ47 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms