Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gtf3c4Q8BMQ2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms