Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

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Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Tubgcp5Q8BKN5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Tubgcp5Q8BKN5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Tubgcp5Q8BKN5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tubgcp5Q8BKN5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tubgcp5Q8BKN5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tubgcp5Q8BKN5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tubgcp5Q8BKN5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tubgcp5Q8BKN5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Tubgcp5Q8BKN5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms