Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnrc6bQ8BKI2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnrc6bQ8BKI2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnrc6bQ8BKI2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnrc6bQ8BKI2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnrc6bQ8BKI2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnrc6bQ8BKI2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnrc6bQ8BKI2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnrc6bQ8BKI2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnrc6bQ8BKI2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnrc6bQ8BKI2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnrc6bQ8BKI2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnrc6bQ8BKI2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms