Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rufy1Q8BIJ7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms