Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Best2Q8BGM5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms