Protein–RNA interactions for Protein: Q811S7

Ubp1, Upstream-binding protein 1, mousemouse

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1Q811S7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubp1Q811S7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubp1Q811S7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubp1Q811S7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubp1Q811S7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubp1Q811S7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ubp1Q811S7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubp1Q811S7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ubp1Q811S7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ubp1Q811S7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubp1Q811S7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubp1Q811S7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubp1Q811S7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubp1Q811S7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubp1Q811S7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubp1Q811S7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubp1Q811S7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubp1Q811S7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubp1Q811S7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubp1Q811S7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubp1Q811S7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubp1Q811S7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubp1Q811S7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubp1Q811S7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubp1Q811S7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubp1Q811S7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubp1Q811S7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubp1Q811S7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ubp1Q811S7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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