Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms