Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms