Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmc8Q7TN58 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmc8Q7TN58 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmc8Q7TN58 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmc8Q7TN58 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmc8Q7TN58 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmc8Q7TN58 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmc8Q7TN58 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmc8Q7TN58 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmc8Q7TN58 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmc8Q7TN58 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmc8Q7TN58 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmc8Q7TN58 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmc8Q7TN58 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmc8Q7TN58 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmc8Q7TN58 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmc8Q7TN58 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmc8Q7TN58 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmc8Q7TN58 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmc8Q7TN58 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmc8Q7TN58 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmc8Q7TN58 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmc8Q7TN58 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmc8Q7TN58 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmc8Q7TN58 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmc8Q7TN58 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms