Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf139Q7TMV1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms