Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup188Q6ZQH8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms