Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Kcnt1Q6ZPR4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Kcnt1Q6ZPR4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Kcnt1Q6ZPR4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kcnt1Q6ZPR4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kcnt1Q6ZPR4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kcnt1Q6ZPR4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kcnt1Q6ZPR4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kcnt1Q6ZPR4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kcnt1Q6ZPR4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kcnt1Q6ZPR4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kcnt1Q6ZPR4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnt1Q6ZPR4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnt1Q6ZPR4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnt1Q6ZPR4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnt1Q6ZPR4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnt1Q6ZPR4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnt1Q6ZPR4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnt1Q6ZPR4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnt1Q6ZPR4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnt1Q6ZPR4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnt1Q6ZPR4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnt1Q6ZPR4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnt1Q6ZPR4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnt1Q6ZPR4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnt1Q6ZPR4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnt1Q6ZPR4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnt1Q6ZPR4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnt1Q6ZPR4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnt1Q6ZPR4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnt1Q6ZPR4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kcnt1Q6ZPR4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms