Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Glis3Q6XP49 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Glis3Q6XP49 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms