Protein–RNA interactions for Protein: Q6VNS1

Ntrk3, NT-3 growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntrk3Q6VNS1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ntrk3Q6VNS1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ntrk3Q6VNS1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ntrk3Q6VNS1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ntrk3Q6VNS1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ntrk3Q6VNS1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ntrk3Q6VNS1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ntrk3Q6VNS1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ntrk3Q6VNS1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ntrk3Q6VNS1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ntrk3Q6VNS1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ntrk3Q6VNS1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Ntrk3Q6VNS1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntrk3Q6VNS1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntrk3Q6VNS1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntrk3Q6VNS1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntrk3Q6VNS1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntrk3Q6VNS1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntrk3Q6VNS1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntrk3Q6VNS1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntrk3Q6VNS1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ntrk3Q6VNS1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ntrk3Q6VNS1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ntrk3Q6VNS1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ntrk3Q6VNS1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ntrk3Q6VNS1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ntrk3Q6VNS1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ntrk3Q6VNS1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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