Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trak1Q6PD31 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms