Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAN7

Prr18, Proline-rich protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr18Q6PAN7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prr18Q6PAN7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms