Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Soga3Q6NZL0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Soga3Q6NZL0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms