Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1Q6NXH3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.3 ms