Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HelbQ6NVF4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms