Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cep78Q6IRU7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cep78Q6IRU7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms