Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms