Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt40Q6IFX3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms