Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6GQU0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6GQU0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6GQU0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6GQU0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6GQU0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6GQU0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6GQU0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6GQU0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6GQU0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6GQU0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6GQU0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6GQU0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6GQU0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6GQU0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6GQU0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6GQU0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6GQU0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6GQU0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6GQU0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6GQU0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6GQU0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6GQU0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q6GQU0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6GQU0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6GQU0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6GQU0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms