Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIA9

Fbxo27, F-box only protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo27Q6DIA9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fbxo27Q6DIA9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms