Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Cep290Q6A078 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Cep290Q6A078 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cep290Q6A078 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cep290Q6A078 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cep290Q6A078 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cep290Q6A078 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cep290Q6A078 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Cep290Q6A078 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cep290Q6A078 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms