Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmcc1Q69ZZ6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Tmcc1Q69ZZ6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmcc1Q69ZZ6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms