Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK0

Prex1, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex1Q69ZK0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prex1Q69ZK0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Prex1Q69ZK0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms