Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a5Q63ZW6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col4a5Q63ZW6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms