Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sp4Q62445 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms