Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six1Q62231 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six1Q62231 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six1Q62231 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six1Q62231 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Six1Q62231 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Six1Q62231 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Six1Q62231 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms